Описание "Наборы реагентов Компании Биоком для обнаружения ДНК возбудителей инфекционных заболеваний"
Наборы реагентов Компании Биоком для обнаружения ДНК возбудителей инфекционных заболеваний
Назначение
Наборы реагентов GenePakTM DNA PCR test предназначены для обнаружения в клинических пробах ДНК возбудителей инфекционных заболеваний человека и животных методом полимеразной цепной реакции (ПЦР).
Наборы реагентов GenePakTM DNA PCR test могут быть использованы в клинической лаборатории для обнаружения ДНК бактериальной, вирусной, грибковой или другой природы, а также для оценки эффективности проводимой терапии.
Время проводимого анализа составляет не более 4 часов.
Наборы рассчитаны на проведение 100 реакций, включающих 10 положительных и 10 отрицательных контрольных образцов.
Принцип действия и аналитические характеристики
Наборы реагентов GenePakTM DNA PCR test основаны на выявлении специфического фрагмента ДНК возбудителя методом ПЦР и представляют собой лиофилизированные сухие реакционные смеси, готовые для амплификации выделенной ДНК.
Выделение ДНК осуществляют двумя способами в зависимости от природы анализируемой биологической пробы.
Детекцию ПЦР-продуктов проводят с использованием метода электрофореза. По наличию специфического фрагмента ДНК судят о присутствии ДНК возбудителя в анализируемом материале.
Чувствительность тест-систем составляет 10 копий матрицы ДНК в 10 мкл исследуемой пробы ДНК.
Состав набора (на 100 выделений)
- (+) control (положительный контрольный образец), готов к применению - красные пробирки с лиофолизованным сухим содержимым синего цвета, 10 шт.
- (-) сontrol (отрицательный контрольный образец), готов к применению - синие пробирки с лиофилизованным сухим содержимым синего цвета, 10 шт.
- MasterMix (МастерМикс), готов к применению - бесцветные пробирки с лиофилизованным сухим содержимым синего цвета для анализа клинических проб, 80 шт.
- PCR Diluent (Растворитель ПЦР), 1 пробирка, 1,0 мл
- PCR Oil (Масло для ПЦР), 1 пробирка, 2,0 мл
Формат пробирок для амплификации 0,2 или 0,5 мл.
Перечень наборов
| Название набора | Наименование патогена |
| AdV gen | Аденовирус (общ.) | Adenovirus general |
| AdV types | Аденовирус генотипы | Adenovirus genotypes |
| Afu | Аспергилус фумигатус | Aspergilus fumigatus |
| Bfr | Бактероид фрагилис | Bacteroides fragilis |
| Bpe | Бордетелла пертусис | Bordetella pertussis |
| Bbu | Боррелия бургдорфери | Borrelia burgdorferi |
| Bga | Боррелия гаринии | Borrelia garinii |
| Baf | Боррелия афзелии | Borrelia afzelii |
| Bor | Боррелия (общ.) | Borrelia spp. (burgdorferi+ garinii+ afzelii) |
| Bru | Бруцелла мелитензиз | Brucella melitensis |
| VZV | Варицелла зостер | Varicella-zoster virus |
| Vch-toxR | Вибрион холеры | Vibrio cholerae (tox R) |
| Vch-оmpW | Вибрион холеры | Vibrio cholerae (оmр W) |
| HBV | Вирус гепатита B | Hepatitis B virus |
| ВHV 1 | Вирус герпеса КРС, тип 1 | Bovine herpes virus, 1 type |
| HSV 1 | Вирус герпеса простого 1 | Herpes simplex virus 1 type |
| HSV 1/2 | Вирус герпеса простого 1 и 2 | Herpes simplex virus 1/2 types |
| HSV 2 | Вирус герпеса простого 2 | Herpes simplex virus 2 type |
| HHV 6 | Вирус герпеса тип 6 | Human herpes virus 6 type |
| HHV 7 | Вирус герпеса тип 7 | Human herpes virus 7 type |
| HHV 8 | Вирус герпеса тип 8 | Human herpes virus 8 type |
| рroBLV | Вирус лейкоза КРС | Bovine leukemia virus |
| HРV gen | Вирус папилломы человека (общ) | Human papillomavirus-450 gen. |
| HPV 16 | Вирус папилломы человека (тип 16) | Human papillomavirus 16 type |
| HPV 18 | Вирус папилломы человека (тип18) | Human papillomavirus 18 type |
| HPV 16/18 | Вирус папилломы человека (16 и 18) | Human papillomavirus 16/18 type |
| HPV l.r. | Вирус папилломы человека неонкогенный (типы 6, 11, 42, 53, 54, 66) | Human papillomavirus, low risk |
| HPV h.r. | Вирус папилломы человека онкогенный (типы 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45) | Human papillomavirus, high risk |
| HPV h.r.+ | Вирус папилломы человека онкогенный +(типы 51, 52, 55, 56, 58, 59, 68, 77, 83) | Human papillomavirus, high risk-plus |
| HPVtypes | Вирус папилломы человека генотипы | Human papillomavirus genotype |
| TTVgen | Вирус ТТ (общ.) | Transfusion transmit. virus, general |
| TTV 1a | Вирус ТТ (тип 1а) | Transfusion transmit. virus, types |
| EBV | Вирус Эпштейн-Барра | Epstein-Barr virus |
| pro HIV I | ВИЧ | Human immunodeficiency virus |
| Gva | Гарднерелла вагиналис | Gardnerella vaginalis |
| Hin | Гемофилическая инфекция | Haemophilus influenzae |
| Gla | Жиардия лямблия | Giardia lamblia |
| Yen | Иерсения энтероколитика | Yersinia enterocolitica |
| Cal | Кандида альбиканс | Candida albicans |
| Cgl | Кандида глабрата | Candida glabrata |
| Cje | Кампилобактер | Campylobacter jejuni |
| Kpn | Клебсиелла пневмониа | Klebsiella pneumoniae |
| Cdi | Клостридиум диффициле | Clostridium difficile |
| Cne | Криптококкус неоформанс | Cryptococcus neoformans |
| Cpa | Криптоспоридиум парвум | Cryptosporidium parvum |
| Lpn | Легионелла пневмофила | Legionella pneumophila |
| Lin | Лептоспира интерроганс | Leptospira interrogans |
| pro HTLV I/II | Т-Лимфотропный вирус человека | HumanT-Lymphotropic virus I/II |
| Lis | Листерия | Listeria spp. |
| Lmo | Листерия моноцитогенес | Listeria monocytogenes |
| Lac | Лактобациллюс общ. | Lactobacillus spp. |
| Lva | Лактобациллюс вагиналис | Lactobacillus vaginalis |
| Mav | Микобактерия авьюм | Mycobacterium avium, subspp. paratuberculosis |
| Mtu | Микобактерия | Mycobacterium tuberculosis |
| M(tu+bo) | Микобактерия (туберкулезис+бовис) | Mycobacterium tuberculosis+bovis |
| Min | Микобактерия интрацеллюлар | Mycobacterium intracellulare |
| Mge | Микоплазма гениталиум | Mycoplasma genitalium |
| Mpn | Микоплазма пневмония | Mycoplasma pneumoniae |
| Mfe | Микоплазма ферментас | Mycoplasma fermentans |
| Mho | Микоплазма хоминис | Mycoplasma hominis |
| Myc | Микоплазма общ. | Mycoplasma spp. |
| Mob | Мобилюнкус куртисии | Mobiluncus curtisii |
| Mmo | Морганелла моргани | Morganella morganii |
| Mca | Моракселла катарралис | Moraxella catarrhalis |
| Ngo | Нейссерия гонорреи | Neisseria gonorrhoea |
| B19 | Парвовирус B19 | Parvovirus B19 |
| Pan | Пептострептококк анаэробный | Peptostreptococcus anaerobius |
| Pca | Пневмоцистис каринии | Pneumocystis carinii |
| JCV, BKV, SV 40 | Полиомавирус JCV, BKV, SV 40 | Poliomavirusis JCV, BKV, SV40 |
| Pbi | Превотелла бивиа | Prevotella bivia |
| Pmi | Протеус мирабилис | Proteus mirabilis |
| Pae | Псевдомонас аэругиноза | Pseudomonas aeruginosa |
| Ric | Риккетсия | Rickettsia rickettsii |
| SENV-D | SEN-вирус D | SEN virus D |
| SENV-D/H | SEN-вирус D/H | SEN virus D/H |
| SENV-H | SEN-вирус H | SEN virus H |
| Sag | Стрептококк агалакта | Streptococcus agalactiae |
| Spy | Стрептококк пиогенус | Streptococcus pyogenes |
| Spn | Стрептококк пневмония | Streptococcus pneumoniae |
| Tgo | Токсоплазма гонди | Toxoplasma gondii |
| Tpa | Трепонема паллидум | Treponema pallidum |
| Tva | Трихомонос вагиналис | Trichomonas vaginalis |
| Ure | Уреаплазма (парвум, уреалитикум) | Ureaplasma (parvum+urealytic.) |
| Upa | Уреаплазма парвум | Ureaplasma parvum, biovar 1 |
| Uur | Уреаплазма уреалититикум | Ureaplasma urealyticum, biovar 2 |
| Ftu | Франчизелла туляренсис | Francisella tularensis |
| Hpy-cagA | Хеликобактер пилори (cagA) | Helicobacter pylori (cagA) |
| Hpy-ure | Хеликобактер пилори (ure) | Helicobacter pylori (ure) |
| Hpy-vacA | Хеликобактер пилори (vacA) | Helicobacter pylori (vacA) |
| Cpn | Хламидия пневмония | Chlamydia pneumoniae |
| Chl | Хламидия общ. | Chlamydia spp. |
| Cps | Хламидия пситтаци | Chlamydia psittaci |
| Ctr | Хламидия трахоматис | Chlamydia trachomatis |
| HCMV | Цитомегаловирус человека | Human cytomegalovirus |
| Ehi | Энтамеба гистолитика | Entamoeba histolitica |
| Efal | Энтерококкус фекалис | Enterococcus faecalis |
| Efam | Энтерококкус фециум | Enterococcus faecium |
| Ehr | Эрлихия общ. | Ehrlichia spp. |
Наборы реагентов для количественного определения ДНК возбудителей инфекционных заболеваний
Назначение
Наборы реагентов GenePakTM Quantitative PCR test предназначены для количественного определения ДНК возбудителей инфекционных заболеваний в плазме или сыворотке крови, цельной крови, спинномозговой жидкости, лимфе, моче, гомогенатах тканей и других пробах человека методом конкурентной полимеразной цепной реакции (competitive PCR).
Наборы реагентов GenePakTM Quantitative PCR test могут быть использованы в клинической лаборатории для определения концентрации ДНК бактериальной, вирусной, грибковой и другой природы в пробах человека при ведении мониторинга проводимой терапии.
Время проводимого анализа после приготовления рабочих растворов составляет не более 4 ч.
Наборы рассчитаны на проведение 140 реакций (20 серий по 6 реакций) и предназначены для исследования 20 клинических проб. В комплект набора также входят по 10 пробирок для проведения реакций положительного и отрицательного контролей.
Формат пробирок для амплификации - 0,5 мл.
Принцип действия
Набор реагентов GenePakTM Quantitative PCR test основан на использовании процесса амплификации ДНК методом конкурентной PCR с раститрованным внутренним контролем (конкурентом), имеющим аналогичные сайты отжига для используемых специфических праймеров. PCR продукты от специфической матрицы и внутреннего контроля отличаются приблизительно на 50-200 пар нуклеотидов (табл.1). Реакцию одновременной амплификации специфической матрицы и внутреннего контроля проводят в серии из 6 пробирок с раститрованным от 101 до 106 копий матрицы внутреннего контроля и одинаковым количеством (объемом) ДНК из анализируемой пробы.
Наборы реагентов GenePakTM Quantitative PCR test представляют собой лиофилизованные сухие смеси, готовые для амплификации выделенной ДНК.
Выделение ДНК проводят по выбору, с помощью пробопоготовки Ускоренной или Универсальной, в зависимости от природы анализируемой биологической пробы.
Детекцию PCR продукта проводят электрофорезом в агарозном геле, окрашенном бромистым этидием, под УФ светом с длиной волны 310 нм. В конкурентных условиях реакции амплификации количество матрицы в анализируемой пробе определяют относительно известного количества копий внутреннего контроля в каждой пробирке из серии.
Аналитические характеристики
При использовании в качестве исходного материала нативной ДНК возбудителя (положительный контрольный образец) на агарозном геле после проведения электрофореза продуктов амплификации под УФ-светом выше ряда полос внутреннего контроля должна появиться полоса, соответствующая определенному размеру матрицы.
При использовании в качестве исходного материала бидистиллированной воды или исходного супернатанта ЭкстраГена в качестве отрицательного контрольного образца после проведения электрофореза на агарозном геле полоса желтого цвета выше ряда полос внутреннего контроля должна отсутствовать.
Интервал количественного определения матрицы ДНК расположен в пределах от 101 до 106 копий в анализируемом объеме 10 мкл (мкг ДНК).
Состав набора (на 20 проб)
- N1 MasterMix (МастерМикс, содержащий 10 копий положительного внутреннего контроля) - пробирки с лиофолизованным сухим содержимым синего цвета, 20 шт;
- N2 MasterMix (МастерМикс, содержащий 102 копий положительного внутреннего контроля) - пробирки с лиофилизованным сухим содержимым синего цвета, 20 шт.;
- N3 MasterMix (МастерМикс, содержащий 103 копий положительного внутреннего контроля) - пробирки с лиофилизованным сухим содержимым синего цвета, 20 шт;
- N4 MasterMix (МастерМикс, содержащий 104 копий положительного внутреннего контроля) - пробирки с лиофилизованным сухим содержимым синего цвета, 20 шт;
- N5 MasterMix (МастерМикс, содержащий 105 копий положительного внутреннего контроля) - пробирки с лиофилизованным сухим содержимым синего цвета, 20 шт;
- N6 MasterMix (МастерМикс, содержащий 106 копий положительного внутреннего контроля) - пробирки с лиофилизованным сухим содержимым синего цвета, 20 шт;
- (+) control (положительный контрольный образец) - красные пробирки с лиофолизованным сухим содержимым синего цвета, 10 шт.;
- (-) сontrol (отрицательный контрольный образец) - синие пробирки с лиофилизованным сухим содержимым синего цвета, 10 шт.;
- Marker M50 (M100) (маркер молекулярной массы М50, М100), зеленые пробирки с лиофилизованным сухим содержимым темно-синего цвета, 10 шт.;
- PCR Diluent (Растворитель ПЦР), 2 пробирки по 1,0 мл;
- PCR Oil (Масло для ПЦР), 2 пробирки по 2,0 мл.
Перечень наборов
| Название набора | Наименование патогена |
| HВV QUANT | Вирус гепатита B |
| HPV 16 QUANT | Вирус папилломы человека (тип 16) |
| HPV h.r. QUANT | Вирус папилломы человека онкоген. |
| TTV gen QUANT | Вирус ТТ (общ.) |
| pro HIV I QUANT | ВИЧ |
| Gva QUANT | Гарднерелла вагиналис |
| Lac QUANT | Лактобациллус общ. |
| Mtu QUANT | Микобактерия туберкулеза |
| Mpn QUANT | Микоплазма пневмония |
| Mfe QUANT | Микоплазма ферментас |
| Mho QUANT | Микоплазма хоминис |
| Ure QUANT | Уреаплазма общ. (парвум+уреалитикум) |
| Cpn QUANT | Хламидия пневмония |
| Ctr QUANT | Хламидия трахоматис |
| CMV QUANT | Цитомегаловирус человека |
| EBV QUANT | Эпштейн-Барра вирус |
Вы можете обратиться за более детальной информацией к производителю "Наборы реагентов Компании Биоком для обнаружения ДНК возбудителей инфекционных заболеваний".
|
Всего в разделе
Обзоры по теме
