Программное обеспечение МЦРУ Сибирь-Н соответствует международному протоколу DICOM3.0, что позволяет обмениваться изображениями с другими медицинскими информационными системами. Программа разрабатывается в тесном сотрудничестве с рентгенологами, поэтому содержит не только общепринятые формализованные протоколы, но и необходимые формы периодических отчетов. В программе заложены практически неограниченные возможности обработки полученного изображения специальными фильтрами. Программа позволяет встраивать дополнительные фильтры обработки изображений, разработанные самостоятельно другими разработчиками.